Sau khi giành được độc lập, Bajor đang bước vào một giai đoạn phát triển mới đầy hy vọng nhưng cũng tiềm ẩn nhiều thử thách. Thuyền trưởng Benjamin Sisko, hiện là hành chính trị quân sự của Deep Space Nine, phải dốc hết nỗ lực để lèo lái nền chính trị phức tạp của hành tinh này, vừa đương đầu với các quan điểm khác nhau từ người Bajor, vừa phải duy trì hòa bình và an ninh khi Bajor trở thành điểm trung gian giao thương sầm uất của khu vực. Tuy nhiên, trong khi Sisko tập trung vào việc ổn định Bajor, những tin đồn về một nền văn minh cường thịnh ẩn giấu ở bên kia lỗ sâu khiến cả vũ trụ Star Trek chấn động. Từ những tiếng động bí ẩn đến các báo cáo về công nghệ vượt trội, những dấu hiệu này báo hiệu một mối đe dọa tiềm ẩn có thể đảo lộn trật tự của vùng trời. Phần hai của Star Trek: Deep Space Nine mang đến một hành trình đầy hồi hộp khi Sisko phải đối diện với những bí ẩn sâu rộng ở đất liền và bí mật ở trong không gian.

Cuộc chiến đấu giữa chính trị, an ninh và các câu hỏi về cuộc sống xa lạ bên kia lỗ sâu sẽ được thổi bùng thành ngọn lửa bi kịch. Liệu Sisko có thể bảo vệ Bajor và giữ vững hòa bình trong khi số phận của nền văn minh phức tạp và đầy bất ngờ đang lan tỏa ra khắp vũ trụ?