Chuẩn bị cho một mùa hè đầy bất ngờ và rộn ràng khi Tom và Jerry: Nhiệm Vụ Điệp Viên mang đến cho bạn một cuộc phiêu lưu ly kỳ chưa từng có. Câu chuyện bắt đầu như thường lệ với những màn đuổi bắt tếu táo giữa hai kẻ thù cổ đại Tom và Jerry trên bãi biển. Tuy nhiên, cuộc đối đầu này bất ngờ biến sang một nhiệm vụ điệp viên khẩn cấp khi đối diện với Jonny Quest, Hadji, và chú chó Bandit. Gia đình Quest danh tiếng, với Johnny, chàng trai thông minh và quả cảm, Hadji, cậu bé hâm mộ khoa học đến từ vùng đất xa lạ, cùng với chú chó Bandit trung thành, đang trong một sứ mệnh đầy rủi ro. Vua ma dữ nhất thế giới, TS. Zin, đã phát hiện ra bí mật: tiến sĩ Benton Quest, cha của Johnny, sở hữu một thiết bị có khả năng giải quyết vấn đề năng lượng toàn cầu. Nỗi khao khát quyền lực đã khiến TS. Zin tung ra đội quân mèo hung dữ để bắt cóc tiến sĩ Benton và vệ sĩ của ông. Chắc chắn Tom và Jerry sẽ không thể ngồi ngoài cuộc chơi. Họ đồng hành cùng Jonny Quest, Hadji, và Bandit trong một cuộc phiêu lưu đầy hồi hộp, bất ngờ, và cười ngất. Bên cạnh những màn đuổi giết hài hước, phim còn mang đến những vụ nổ mãnh liệt, những chiến đấu kịch tính và những tình huống rắc rối khó lường. Phải chăng Tom và Jerry có thể kết hợp với Jonny Quest và những người bạn của mình để giải cứu tiến sĩ Benton và ngăn chặn âm mưu phạm tội của TS. Zin?